江苏:5.7万份种子列队领取“数字身份证”

2022-10-26 13:01:14 0

江苏:5.7万份种子列队领取“数字身份证”

  “咱们方才又完成为了2000份玉米种质资本的基因测序以及数据阐发事情,给这些种子创建了‘数字身份证’,以后的生物育种将加倍精准、高效。”10月25日,在江苏省农业种质资本综合基因库,江苏省农业科学院(如下简称江苏省农科院)种质资本与生物技能研究所玉米种质资本立异团队副研究员周玲说着打开数据库。科技日报记者望到这内里已经经贮存了近1万份种质资本基因组测序阐发数据。

  2020年6月,江苏省农业科学院在海内率先搭建数字化育种平台,展开年夜规模种质资本基因测序以及数据阐发,今朝已经完成2352份水稻、5082份玉米、1344份桃、366份草莓、473份辣椒等种质资本的数字化存储。

  种业立异是农业科技立异的焦点问题,展开种源“卡脖子”技能攻关,起首要把种质资本庇护操纵好。

  “今朝,江苏省农作物种质资本中期库已经采集保留农作物种质资本5.7万份,涵盖54种作物,触及14个植物科、56个属以及96个物种。”江苏省农科院种质资本与生物技能研究所所长赵涵先容,此中水稻种质资本15000余份、小麦种质资本15000余份、玉米种质资本6000余份,具备光鲜之处特点,包含长江中下流尤为是太湖流域的水稻处所品种、南边六省一市冬麦区的小麦处所品种、江苏处所糯玉米品种。

  当前,以“新一代数字科技与生物技能深度交融”为特性的伶俐育种期间正加快到来,中国种业成长面对史无前例的机会与挑战。构建数字化育种平台,实现育种数据化、网络化、智能化,已经成为晋升育种效能的主流趋向以及基础方式。

  建设进步前辈的数字化种质资本平台是夯实种质资本根本的关头。本年2月,《国务院关于印发“十四五”推动农业屯子现代化计划的通知》指出,要增强种质资本庇护,构建种质资本DNA份子指纹图谱库、特性库以及农业种质资本数据库。

  赵涵说,数字化育种平台经由过程构建高精度模子、连系基因编纂技能,可以或许先展望育种,既省往田间播种实验的年夜量人力,又节流了试验时间、提高了科研效率。

  “一株水稻的基因数据量可达400M摆布,一个泛泛的64G闪存盘只能存储十几株水稻的基因组数据。”赵涵先容,生物基因组的数目十分巨大,建设数字化的种质资本库亟须海量存储以及高机能计较技能,才干为接下来的人工智能育种打下根本。

  “今朝,数字化育种平台的总体架构设计已经开端完成,主要由表型数据库、基因型数据库、数据计较以及阐发平台3个模块构成。”周玲先容,一粒种子从什物酿成基因数据其实不容易:起首在田地里种下种子,长年夜后从叶片中提取DNA入行质检;第二步是送到试验室对于样品入行处置以及上机测序,得到基因组上的小片断;最后再操纵生物信息学软件,将序列信息转化为靠得住的变异信息,再对于变异的信息入行判读。

  周玲诠释说,每一一种生物都有尺度的参考基因组,只有入行对照后才干断定检测的种质资本是否变异,如许就能从基因组层面追溯种子来历,为种子创建一个唯一无二的“数字身份证”。

  今朝,江苏省农科院与相干企业互助开发的变异过滤软件,一天可阐发30—40个玉米品种,比传统软件阐发速度晋升约40倍。

  “下一步,咱们将聚焦个体上风种质资本(比方水稻、草莓),凭据专业特色展开详细施行以及分工互助,完成平台框架的搭建。”赵涵说,将来数据库创建完成后,连系数据阐发与育种份子技能,将形成一个现代化的数字育种平台。(科技日报 记者 张晔)

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