西南年夜学蚕学科研团队绘就全球首张家蚕超等泛基因组图谱

　　重庆10月9日电 (记者 钟旖)西南年夜学9日召开新闻公布会颁布发表，该校科研团队胜利绘就家蚕超等泛基因组图谱，这是迄今动植物中最年夜的长读长泛基因组，活着界上率先实现家蚕基因库数字化，建立“数字家蚕”。

　　研究功效作为世界家蚕基因组研究的新里程碑，将开启家蚕设计育种以及多元立异操纵新期间。相干研究论文日前在国际期刊Nature Co妹妹unications在线发表。

图为现场展现的蚕茧。　周毅 摄

　　“西南年夜学拥有世界规模最年夜的家蚕基因库，笼盖全球90%以上的家蚕遗传变异资本，是咱们展开超等泛基因组研究的上风。”西南年夜学家蚕基因组生物学国度重点试验室主任、国度蚕桑工业技能系统首席科学家代方银传授先容说，超等泛基因组，是一个物种所有基因组信息的总以及，对于深化功能基因组研究、种质立异等意义重年夜。其团队对于1078份蚕种质资本(205份处所种、194份改进种、632份遗传质料、47份野桑蚕)入行了深度二代测序，对于此中545份代表性资本入行了三代测序，发生55.57T基因组数据，组装了545个蚕的高质量基因组，对于100个基因组入行了基因注释，鉴定到4300余万个SNP、930余万个Indel、340余万个布局变异(SV)以及7308个新基因(家族)，绘制了高精度家蚕泛基因组图谱，席卷了今朝最周全的家蚕以及野桑蚕基因组信息。

图为现场展现的蚕。　周毅 摄

　　代方银说，这一功效将开启家蚕功能基因组研究以及份子育种研究的新篇章。好比可以高效率、高通量对于接基因型以及表型，邃密解析节制性状的遗传根本；可以针对于基因组全区域入行研究，不只局限于基因组不到3%的基因编码区；可以对于基因组里年夜片断布局变异入行研究，包含基因重复，年夜片断插进、缺失、倒位以及染色体断裂、交融等。

　　详细以鉴定特定性状的基因或者其因果变异事情来讲，此前像“年夜海捞针”，家蚕超等泛基因组图谱如同邃密网格化的“坐标”，对于里手行家来讲，直接对于接表型以及基因组暗码像是“查字典”般容易。

图为545个蚕基因组的布局变异特性。　家蚕基因组生物学国度重点试验室供图

　　值患上一提的是，在这次家蚕超等泛基因组研究中，还取患了其他首要科学发明：经由过程比力千余个蚕的基因组信息，终极揭示了家蚕起源于中国黄河中下流地域；研究鉴定到数百个驯化、改进的相干基因以及变异，说明了中国实用种以及日本实用种杂交发生最凸起杂种上风种的遗传根本，将推进“超等蚕”育种规划实现；研究揭示了茧丝产量以及质量的关头节制基因，将为家蚕份子育种提供直接靶标；运用家蚕超等泛基因组，肯定了虫豸警惕色以及胚胎滞育的关头基因、邃密的基因组变异特性，对于理解虫豸情况顺应性机制具备首要意义。

　　代方银暗示，下一步，家蚕基因组生物学国度重点试验室还将搭建泛基因组数据库，促成家蚕根本研究；深度剖析基因组内在，助力遗传入化研究；同时，体系发掘家蚕的优秀基因，促成家蚕品种选育以及多元化操纵，拓铺其他新功能、新型质料的开发。(完)

图为家蚕生命周期各阶段丰硕的表型多样性。　家蚕基因组生物学国度重点试验室供图

关键字：  家蚕品种  基因组图谱  编码区  基因重复  滞育